Думаю, что люди едут на Памир через Кара-Балты потому, что дорога М41 изумительно красива. Хотя, с тех времен, как под перевалом Тюз-Ашу прорыли тоннель, часть своей прелести она, конечно, потеряла. И, насколько я знаю и понимаю, по "исторической дороге" проехать сейчас нельзя.
Возможно, многие едут так только потому, что это короче, но им везет по части увиденных красот. Можно сколько угодно говорить, что красота - понятие относительное, но М41 в этой части настолько красива, что никакой Иссык-Куль с ней и рядом не стоял.
Посмотреть вложение 56610
Другое дело, если надо ехать и туда и обратно, тогда да: можно (и, видимо, "правильно") проехать и там, и там.
На Памире очень давно не был. Тамошние дороги тоже помню с 70-х, но "по виденному-прочитанному на сегодняшний день" у меня сложилось впечатление, что сейчас трасса в таджикской ее части стала гораздо хуже. При всем скептицизме по поводу СССР и "совка", в те времена дорога имела пресловутое (или нет?) стратегическое значение, раскиданные вдоль нее погранзаставы надо было снабжать... Короче, за дорогой, что называется, следили. На Яве она проходилась вообще без проблем, не считая бродов из-за некоторых подмытых мостов. Сейчас, может, тоже следят, но тогдашнего уровня, как я вижу, пока не достигли. Ибо времена бардака свой отпечаток там оставили. )